Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VcpQ01853 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VcpQ01853 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VcpQ01853 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VcpQ01853 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms