Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd1Q01822 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd1Q01822 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd1Q01822 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms