Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec23aQ01405 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec23aQ01405 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec23aQ01405 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sec23aQ01405 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms