Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pou1f1Q00286 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pou1f1Q00286 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou1f1Q00286 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms