Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shc1P98083 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc1P98083 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms