Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gata5P97489 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gata5P97489 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms