Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3aP97351 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3aP97351 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rps3aP97351 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms