Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mesp1P97309 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mesp1P97309 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mesp1P97309 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms