Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms