Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tubg1P83887 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubg1P83887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tubg1P83887 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms