Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Irx3P81067 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Irx3P81067 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx3P81067 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Irx3P81067 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irx3P81067 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms