Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx2P81066 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx2P81066 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx2P81066 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx2P81066 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx2P81066 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx2P81066 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx2P81066 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx2P81066 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx2P81066 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx2P81066 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irx2P81066 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx2P81066 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms