Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiitaP79621 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiitaP79621 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiitaP79621 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiitaP79621 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiitaP79621 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms