Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb6P70689 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gjb6P70689 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms