Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf3P70671 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irf3P70671 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf3P70671 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf3P70671 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf3P70671 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms