Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sparcl1P70663 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sparcl1P70663 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sparcl1P70663 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms