Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SeboxP70368 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SeboxP70368 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SeboxP70368 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SeboxP70368 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeboxP70368 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms