Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkcbP68404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PrkcbP68404 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms