Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg1P63260 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Actg1P63260 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Actg1P63260 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms