Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtnP63089 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtnP63089 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtnP63089 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtnP63089 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtnP63089 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtnP63089 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtnP63089 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtnP63089 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtnP63089 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtnP63089 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtnP63089 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtnP63089 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtnP63089 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtnP63089 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtnP63089 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtnP63089 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PtnP63089 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtnP63089 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtnP63089 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtnP63089 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtnP63089 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtnP63089 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtnP63089 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtnP63089 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms