Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gabrb3P63080 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gabrb3P63080 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gabrb3P63080 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms