Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Uba52P62984 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uba52P62984 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Uba52P62984 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms