Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ElobP62869 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ElobP62869 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ElobP62869 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ElobP62869 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ElobP62869 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ElobP62869 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ElobP62869 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ElobP62869 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms