Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl23P62830 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl23P62830 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms