Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl23aP62751 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl23aP62751 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl23aP62751 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms