Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lsm5P62322 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lsm5P62322 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms