Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc5P62196 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc5P62196 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmc5P62196 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms