Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmc1P62192 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psmc1P62192 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmc1P62192 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms