Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ufm1P61961 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ufm1P61961 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms