Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl27P61358 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl27P61358 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl27P61358 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms