Protein–RNA interactions for Protein: P61213

Arl4a, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4aP61213 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arl4aP61213 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arl4aP61213 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arl4aP61213 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arl4aP61213 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arl4aP61213 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arl4aP61213 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 283.6 ms