Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcbp1P60335 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcbp1P60335 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms