Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hps5P59438 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hps5P59438 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps5P59438 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hps5P59438 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps5P59438 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hps5P59438 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms