Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm2P58774 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm2P58774 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm2P58774 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms