Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpm1P58771 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm1P58771 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm1P58771 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms