Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Paxbp1P58501 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxbp1P58501 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms