Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtdsplP58465 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtdsplP58465 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtdsplP58465 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtdsplP58465 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtdsplP58465 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms