Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Strn4P58404 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Strn4P58404 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Strn4P58404 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Strn4P58404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Strn4P58404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms