Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PtpaP58389 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpaP58389 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtpaP58389 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PtpaP58389 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtpaP58389 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpaP58389 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpaP58389 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PtpaP58389 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtpaP58389 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtpaP58389 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpaP58389 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpaP58389 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpaP58389 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PtpaP58389 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtpaP58389 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpaP58389 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PtpaP58389 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpaP58389 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms