Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smpdl3bP58242 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smpdl3bP58242 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms