Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rp1P56716 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rp1P56716 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rp1P56716 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1P56716 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1P56716 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rp1P56716 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms