Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CckbrP56481 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CckbrP56481 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CckbrP56481 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CckbrP56481 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms