Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab4aP56371 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab4aP56371 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab4aP56371 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms