Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NcanP55066 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NcanP55066 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NcanP55066 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NcanP55066 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NcanP55066 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcanP55066 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcanP55066 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NcanP55066 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NcanP55066 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcanP55066 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcanP55066 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcanP55066 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NcanP55066 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NcanP55066 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NcanP55066 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NcanP55066 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NcanP55066 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NcanP55066 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NcanP55066 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcanP55066 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcanP55066 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcanP55066 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcanP55066 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NcanP55066 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NcanP55066 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NcanP55066 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NcanP55066 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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