Protein–RNA interactions for Protein: P54763

Ephb2, Ephrin type-B receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb2P54763 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb2P54763 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb2P54763 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb2P54763 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ephb2P54763 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb2P54763 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb2P54763 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms