Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad23aP54726 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms