Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab2aP53994 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rab2aP53994 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab2aP53994 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rab2aP53994 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms