Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PctpP53808 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PctpP53808 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PctpP53808 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PctpP53808 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PctpP53808 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PctpP53808 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PctpP53808 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PctpP53808 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PctpP53808 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PctpP53808 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PctpP53808 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PctpP53808 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PctpP53808 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PctpP53808 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PctpP53808 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PctpP53808 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PctpP53808 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PctpP53808 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PctpP53808 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PctpP53808 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PctpP53808 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PctpP53808 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PctpP53808 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms