Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Cux1P53564 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cux1P53564 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux1P53564 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux1P53564 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cux1P53564 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cux1P53564 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Cux1P53564 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Cux1P53564 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms