Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Pold1P52431 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pold1P52431 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pold1P52431 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms