Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec1P51908 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec1P51908 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apobec1P51908 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apobec1P51908 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms